3月

2009年3月14日，《三江源区水资源综合规划》和《青海湖流域水资源综合规划》通过国家水利部水规总院审定，三江源区将结束无水资源规划的历史。

2009年3月30日，《草地蝗虫生物防治技术规程》、《草地鼠害生物防治技术规程》、《草地毛虫生物防治技术规范》、《鹰架招鹰控制草地鼠害技术规程》四个三江源生态环境保护地方标准正式发布。

4月

2009年4月20日，青海省人民政府印发了“关于进一步实施好三江源自然保护区生态保护和建设工程的若干意见”，就加强三江源生态保护和建设工程管理、进一步规范项目建设、加强生态移民社区管理、积极扶持生态移民发展后续产业、建立健全退牧还草工程草畜平衡保障机制提出了明确要求。

2009年4月30日，《青海三江源生态保护和建设工程档案资料管理规范》印发。

5月

2009年5月2日，《中国三江源生态价值及补偿机制研究》一书由中国环境科学出版社出版发行。

2009年5月19日，《青海三江源生态保护和建设工程专家库》建成，271名国内外生态、环境、草原、畜牧、农林、水利、能源等领域的专家学者首批人编。

6月

2009年6月22日，“三江源区湿地保护修复技术的引进与示范”科研课题通过省级验收。

7月

2009年7月14日，三江源头科学考察成果通过专家组评审。至此，长江、黄河、澜沧江长度及源头地理坐标被正式确定。

2009年7月20日，青海省政府召开“2005-2008年三江源生态保护和建设工程实施工作总结表彰会。”37个先进单位、65名先进个人和19名牧区致富带头人受到表彰奖励。

8月

2009年8月4日至8日，全国政协“三江源生态保护和建设”调研组一行20人在果洛藏族自治州开展三江源生态保护和建设情况专题调研。

10月

2009年10月28日，《青海三江源自然保护区生态移民困难群众发放生活困难补助管理办法》印发。